O La Paz El Alto Intl é o aeroporto principal em que a EcoJet opera. O Cochabamba J Wilsterman e o Santa Cruz da Serra Aeroporto de Santa Cruz Viru Viru também são aeroportos populares que a EcoJet utiliza regularmente.
Para conheceres o estado de qualquer voo da EcoJet, usa o Monitorizador de voos. Basta introduzires o nome de um aeroporto ou número de voo e clicar em Monitorizar voo para receberes atualizações como horas de partida e chegada ou números de porta e terminal. Também podes receber atualizações acerca do estado de um voo diretamente da EcoJet, ao ligar para o +591 901 10 50 55 ou no site da companhia (ecojet.bo).